【Numpy核心编程攻略:Python数据处理、分析详解与科学计算】1.10 文本数据炼金术:从CSV到结构化数组
1.10 《文本数据炼金术:从CSV到结构化数组》
目录
1.10.1 引言
在数据科学和机器学习领域,处理文本数据是一项常见的任务。CSV(Comma-Separated Values)文件是一种常用的文本数据格式,它们以逗号分隔的值来存储数据。将CSV文件转换为NumPy的结构化数组可以显著提高数据处理的效率和灵活性。本文将详细探讨如何从CSV文件中读取数据并将其转换为NumPy的结构化数组,同时介绍处理缺失值、大文件分块读取优化、时区转换等高级处理技巧,并与Pandas进行互操作对比。
1.10.2 结构化数据类型定义详解
1.10.2.1 什么是结构化数组?
结构化数组(Structured Array)是NumPy中的一种高级数据类型,它允许每个字段有不同的数据类型。与普通的NumPy数组相比,结构化数组具有更强的描述性和灵活性,适用于处理复杂的数据结构。
1.10.2.2 创建结构化数组
可以使用numpy.dtype
对象来定义结构化数据类型。以下是一个简单的例子:
import numpy as np# 定义结构化数据类型
dtype = np.dtype([('name', 'U20'), # 姓名,使用Unicode字符串,最多20个字符('age', 'i4'), # 年龄,使用32位整数('gender', 'U10'), # 性别,使用Unicode字符串,最多10个字符('height', 'f8') # 身高,使用64位浮点数
])# 创建结构化数组
data = np.array([('Alice', 25, 'Female', 165.5),('Bob', 30, 'Male', 175.0),('Charlie', 35, 'Male', 180.0)
], dtype=dtype)print(data)
1.10.2.3 数据类型映射表(Python↔NumPy)
Python Data Type | NumPy Data Type |
---|---|
int | ‘i4’ |
float | ‘f8’ |
str | ‘U20’ or ‘S20’ |
bool | ‘b1’ |
datetime | ‘datetime64’ |
None | ‘O’ (object) |
1.10.2.4 结构化数组的操作
结构化数组支持各种NumPy的操作,如索引、切片、排序等。以下是一些示例:
# 索引
print(data['name']) # 输出所有姓名# 切片
print(data[1:3]) # 输出第2和第3个记录# 排序
sorted_data = np.sort(data, order='age') # 按年龄排序
print(sorted_data)
1.10.2.5 多字段排序
多字段排序允许我们根据多个字段对结构化数组进行排序。例如,我们可以先按年龄排序,再按身高排序:
sorted_data = np.sort(data, order=['age', 'height'])
print(sorted_data)
1.10.2.6 内存效率
结构化数组在内存使用上比普通数组更高效,因为它可以精确地存储每个字段的数据类型和大小。这对于处理大规模数据集非常有帮助。
1.10.3 处理缺失值的5种策略
1.10.3.1 填充默认值
对于缺失值,最简单的处理方式是填充默认值。例如,对于整数字段,可以填充0;对于浮点数字段,可以填充np.nan
。
data = np.array([('Alice', 25, 'Female', 165.5),('Bob', 30, 'Male', np.nan), # 缺失值('Charlie', 35, 'Male', 180.0)
], dtype=dtype)# 填充默认值
data['height'] = np.nan_to_num(data['height'], nan=0.0) # 将nan填充为0.0
print(data)
1.10.3.2 插值
插值是一种常用的数据填充方法。NumPy提供了多种插值方法,如线性插值和最近邻插值。
import pandas as pddf = pd.DataFrame(data)
df['height'] = df['height'].interpolate() # 线性插值
data = df.to_records(index=False) # 转换回NumPy结构化数组
print(data)
1.10.3.3 删除缺失值的记录
如果缺失值不影响整体数据,可以考虑删除这些记录。
data = data[~np.isnan(data['height'])] # 删除height字段为nan的记录
print(data)
1.10.3.4 使用掩码数组
NumPy的掩码数组(Masked Array)可以方便地处理缺失值。
masked_data = np.ma.masked_invalid(data['height']) # 创建掩码数组
print(masked_data)
1.10.3.5 使用特殊标记
在某些情况下,可以使用特殊标记来表示缺失值,例如-1或-999。
data['height'] = np.where(np.isnan(data['height']), -999, data['height']) # 将nan填充为-999
print(data)
1.10.4 大文件分块读取优化
1.10.4.1 问题背景
处理大规模的CSV文件时,一次性加载所有数据到内存中可能会导致内存溢出。因此,需要使用分块读取的方法来优化性能。
1.10.4.2 使用numpy.loadtxt
分块读取
numpy.loadtxt
可以通过设置skiprows
和max_rows
参数来实现分块读取。
import numpy as npdef read_chunk(file, dtype, skiprows, max_rows):return np.loadtxt(file, dtype=dtype, delimiter=',', skiprows=skiprows, max_rows=max_rows)# 定义结构化数据类型
dtype = np.dtype([('name', 'U20'),('age', 'i4'),('gender', 'U10'),('height', 'f8')
])# 读取大文件
chunk_size = 1000
with open('large_file.csv', 'r') as file:for i in range(0, 10000, chunk_size):chunk = read_chunk(file, dtype, i, chunk_size)print(f"读取了第{i + 1}到第{i + chunk_size}行数据")print(chunk)
1.10.4.3 使用生成器实现流式处理
生成器是一种更高效的方法,可以在读取数据时进行处理,而无需将所有数据加载到内存中。
def read_csv_in_chunks(file, dtype, chunk_size=1000):with open(file, 'r') as f:while True:chunk = np.loadtxt(f, dtype=dtype, delimiter=',', max_rows=chunk_size)if len(chunk) == 0:breakyield chunk# 读取大文件
dtype = np.dtype([('name', 'U20'),('age', 'i4'),('gender', 'U10'),('height', 'f8')
])for i, chunk in enumerate(read_csv_in_chunks('large_file.csv', dtype)):print(f"读取了第{i * chunk_size + 1}到第{(i + 1) * chunk_size}行数据")print(chunk)
1.10.4.4 Dask库的使用
Dask是一个用于并行计算的库,可以轻松处理大规模的数据集。
import dask.array as da# 读取大文件
dask_data = da.from_csv('large_file.csv', dtype=dtype, blocksize=1000 * 1024) # 每块1MB
print(dask_data)
1.10.5 时区转换等高级处理
1.10.5.1 时区转换的重要性
在处理时间数据时,时区转换是一个关键步骤。不同的时区会导致时间戳的不一致,影响数据分析的准确性。
1.10.5.2 时区转换的实现
NumPy的时间戳类型datetime64
支持时区转换。以下是一个简单的示例:
import numpy as np
import pytz
from datetime import datetime# 生成带时区的日期时间
dt = np.datetime64('2023-01-01T00:00:00', 'ns').astype(datetime).replace(tzinfo=pytz.utc)
print(dt)# 转换时区
dt = dt.astimezone(pytz.timezone('Asia/Shanghai'))
print(dt)
1.10.5.3 带时区的时间戳转换实战
实际应用中,我们可能需要处理包含时间戳的CSV文件,并进行时区转换。
import numpy as np
import pytz
from datetime import datetime# 定义结构化数据类型
dtype = np.dtype([('name', 'U20'),('age', 'i4'),('gender', 'U10'),('timestamp', 'datetime64[ns]') # 时间戳字段
])# 读取数据
data = np.loadtxt('large_file.csv', dtype=dtype, delimiter=',')# 转换时区
def convert_timezone(timestamp, from_tz, to_tz):dt = timestamp.astype(datetime).replace(tzinfo=from_tz)return dt.astimezone(to_tz).timestamp()from_tz = pytz.utc
to_tz = pytz.timezone('Asia/Shanghai')data['timestamp'] = np.vectorize(convert_timezone)(data['timestamp'], from_tz, to_tz)
print(data)
1.10.5.4 时区转换的性能优化
时区转换是一个计算密集型操作,可以使用NumPy的矢量化函数来提高性能。
# 矢量化时区转换函数
convert_timezone_vec = np.vectorize(convert_timezone, otypes=[np.float64])data['timestamp'] = convert_timezone_vec(data['timestamp'], from_tz, to_tz)
print(data)
1.10.6 结构化数组与Pandas的互操作对比
1.10.6.1 Pandas的优势
Pandas是Python中处理数据的最常用库之一,它提供了丰富的数据处理功能和高效率的性能。
1.10.6.2 从Pandas DataFrames到NumPy结构化数组
Pandas DataFrames可以轻松地转换为NumPy的结构化数组。
import pandas as pd
import numpy as np# 读取CSV文件
df = pd.read_csv('large_file.csv')# 转换为NumPy结构化数组
dtype = np.dtype([('name', 'U20'),('age', 'i4'),('gender', 'U10'),('height', 'f8')
])data = df.to_records(index=False, convert_datetime64=True, dtype=dtype)
print(data)
1.10.6.3 从NumPy结构化数组到Pandas DataFrames
同样,NumPy的结构化数组也可以轻松地转换为Pandas DataFrames。
# 转换为Pandas DataFrames
df = pd.DataFrame(data)
print(df)
1.10.6.4 性能对比
在处理大规模数据时,NumPy通常比Pandas更高效。以下是一个简单的性能对比示例:
import time# 生成大规模数据
large_data = np.array([(f'User{i}', np.random.randint(18, 80), np.random.choice(['Male', 'Female']), np.random.rand())for i in range(1000000)
], dtype=dtype)# 使用NumPy处理
start_time = time.time()
numPy_data = np.sort(large_data, order='age')
end_time = time.time()
print(f"NumPy处理时间: {end_time - start_time:.2f}秒")# 使用Pandas处理
df = pd.DataFrame(large_data)
start_time = time.time()
pandas_data = df.sort_values(by='age')
end_time = time.time()
print(f"Pandas处理时间: {end_time - start_time:.2f}秒")
1.10.7 总结
本文详细介绍了如何从CSV文件中读取数据并将其转换为NumPy的结构化数组。我们讨论了结构化数据类型的定义、缺失值的处理、大文件的分块读取优化、时区转换等高级处理技巧,并与Pandas进行了互操作对比。
参考文献
参考资料名称 | 链接 |
---|---|
NumPy官方文档 | https://numpy.org/doc/stable/ |
Pandas官方文档 | https://pandas.pydata.org/docs/ |
Dask官方文档 | https://docs.dask.org/en/latest/ |
Python官方文档 | https://docs.python.org/3/ |
《NumPy用户指南》 | https://numpy.org/doc/stable/user/index.html |
《Pandas用户指南》 | https://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/user_guide/index.html |
《Dask用户指南》 | https://docs.dask.org/en/latest/user.html |
《Python数据科学手册》 | https://jakevdp.github.io/PythonDataScienceHandbook/ |
《NumPy教程》 | https://towardsdatascience.com/numpy-tutorial-e0ebc6d53b6f |
《Pandas教程》 | https://towardsdatascience.com/pandas-tutorial-906df96a3e50 |
《Dask教程》 | https://towardsdatascience.com/dask-tutorial-20e2ff974da1 |
《NumPy性能优化》 | https://realpython.com/faster-numpy-arrays-cython/ |
《Pandas性能优化》 | https://towardsdatascience.com/10-tips-for-faster-pandas-1e52b1d465bb |
《Dask性能优化》 | https://medium.com/condition-red/dask-performance-tips-6d6ce01646c2 |
《NumPy结构化数组详解》 | https://numpy.org/doc/stable/user/basics.rec.html |
《Pandas处理缺失值》 | https://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/user_guide/missing_data.html |
《Dask读取大文件》 | https://docs.dask.org/en/latest/array-creation.html |
《NumPy时区转换》 | https://numpy.org/doc/stable/reference/arrays.datetime.html |
《Pandas时区转换》 | https://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/user_guide/timeseries.html |
《Dask流式处理》 | https://docs.dask.org/en/latest/delayed.html |
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《NumPy和Pandas互操作》 | https://numpy.org/doc/stable/user/basics.interface.html |
《NumPy和Pandas性能对比》 | https://towardsdatascience.com/performance-comparison-of-numpy-vs-pandas-vs-python-list-2c96d35c8b00 |
《NumPy和Pandas在数据科学中的应用》 | https://medium.com/@a/data-science-with-numpy-and-pandas-8d2b4c0a4e58 |
《NumPy和Pandas的最佳实践》 | https://towardsdatascience.com/numpy-and-pandas-best-practices-b0e0dee09e73 |
《NumPy和Pandas处理大文件的技巧》 | https://towardsdatascience.com/working-with-large-data-in-python-and-pandas-9c0ea4d44feb |
这篇文章包含了详细的原理介绍、代码示例、源码注释以及案例等。希望这对您有帮助。如果有任何问题请随私信或评论告诉我。
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需要升级到WGCLOUD的v3.5.7或者以上版本,才会支持自定义设置主题背景色 WGCLOUD下载:www.wgstart.com 我们登录后,在右上角点击如下的小图标,就可以设置主题背景色了,包括:经典白(默认&#x…...
【Elasticsearch】中数据流需要配置索引模板吗?
是的,数据流需要配置索引模板。在Elasticsearch中,数据流(Data Streams)是一种用于处理时间序列数据的高级结构,它背后由多个隐藏的索引组成,这些索引被称为后备索引(Backing Indices࿰…...
Python 合并 Excel 单元格
合并 Excel 单元格是 Excel 数据处理和表格设计中的一项常用操作。例如,在制作表格标题时,经常会将多个单元格合并,使标题能够跨列显示,更加醒目和美观。此外,当对数据进行分类时,为了使同一类别的数据在视…...
C++中左值和右值的概念
文章目录 一、概要二、左值(Lvalue)二、右值(Rvalue)三、左值引用和右值引用四、左值和右值的使用场景五、总结 一、概要 在 C 中,左值(Lvalue)和右值(Rvalue)是两个非常…...
27.日常算法
1. 最后一个单词的长度 题目来源 给你一个字符串 s,由若干单词组成,单词前后用一些空格字符隔开。返回字符串中 最后一个 单词的长度。单词 是指仅由字母组成、不包含任何空格字符的最大子字符串。 示例 1: 输入:s “Hello Wor…...
动态规划DP 数字三角形模型 传纸条(题目分析+C++完整代码)
传纸条 原题链接 AcWing 275. 传纸条 题目描述 小渊和小轩是好朋友也是同班同学,他们在一起总有谈不完的话题。 一次素质拓展活动中,班上同学安排坐成一个 m行 n 列的矩阵,而小渊和小轩被安排在矩阵对角线的两端,因此&#x…...
Spark入门(Python)
目录 一、安装Spark 二、Spark基本操作 一、安装Spark pip3 install pyspark 二、Spark基本操作 # 导入spark的SparkContext,SparkConf模块 from pyspark import SparkContext, SparkConf # 导入os模块 import os # 设置PYSPARK的python环境 os.environ[PYSPARK_PYTHON] &…...