R --- Error in library(***) : there is no package called ‘***’ (服务器非root用户)
步骤
- 步骤一:在自己目录下创建R包安装路径
- 步骤二:配置用户本地的R库路径
- 步骤三:安装缺失的包(在终端)
- 步骤四:验证安装
步骤一:在自己目录下创建R包安装路径
mkdir -p ~/R_libs
步骤二:配置用户本地的R库路径
在家目录下,编辑(或新建).Renviron文件:
vim ~/.Renviron
在文件内写入如下内容: R_LIBS_USER=~/R_libs
,保存后退出。
步骤三:安装缺失的包(在终端)
在终端运行:
module add apps/R/4.3.2
module add compiler/gnu/8.3.0_fortranR
进入R后,执行:
install.packages('mice', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('lme4', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('lmerTest', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('piecewiseSEM', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('openxlsx', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('dplyr', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('ggplot2', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('DiagrammeR', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('sjPlot', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
步骤四:验证安装
退出R:
quit()
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