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RFDiffusion 计算二面角函数解读

th_dih函数来自util.py包,get_dih函数来自kinematics.py包。th_dih函数计算输入向量定义的二面角的余弦值和正弦值,返回一个包含 (cos⁡(ϕ),sin⁡(ϕ)) 的张量。get_dih 函数计算的是传统意义上的二面角。

源代码:

def th_dih_v(ab, bc, cd):def th_cross(a, b):a, b = torch.broadcast_tensors(a, b)return torch.cross(a, b, dim=-1)def th_norm(x, eps: float = 1e-8):return x.square().sum(-1, keepdim=True).add(eps).sqrt()def th_N(x, alpha: float = 0):return x / th_norm(x).add(alpha)ab, bc, cd = th_N(ab), th_N(bc), th_N(cd)n1 = th_N(th_cross(ab, bc))n2 = th_N(th_cross(bc, cd))sin_angle = (th_cross(n1, bc) * n2).sum(-1)cos_angle = (n1 * n2).sum(-1)dih = torch.stack((cos_angle, sin_angle), -1)return dihdef th_dih(a, b, c, d):return th_dih_v(a - b, b - c, c - d)def get_d

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